Helmholtz Munich 파비안 테이스, 가상 세포 모델과 바이오허브 18억 달러 데이터 투자 방향 논의

Controlling Biology - Fabian Theis, Helmholtz Munich

Latent Space 인터뷰에 출연한 헬름홀츠 뮌헨의 파비안 테이스는 다중 스케일·다중 모달 생물 데이터를 다루는 가상 세포(Virtual Cell) 연구의 흐름을 설명했다. 바이오허브가 발표한 18억 달러 규모 데이터 수집 계획이 이 분야의 핵심 쟁점으로 다뤄졌다. 기사에 따르면 바이오허브의 18억 달러 약정은 바이오허브, NIH, DOE, Google, Meta가 참여한 것으로, 새로운 이미징·측정 기술로 대규모 데이터셋을 만들고 이를 AI 학습에 쓸 수 있도록 공개하는 것이 목표다. 기사는 DOE와 NIH가 대규모 lab-in-the-loop 자동화 역량을 개발 중이며, Google이 커넥토믹스 역량을 확장하고 있고, 바이오허브가 레이저 위상판 현미경과 라이트시트 현미경 등의 이미징 플랫폼을 성숙시키고 있다고 전했다. 기사는 가상 세포 모델링의 한계도 짚었다. 2025년 Arc Virtual Cell Challenge 이후 여러 논문이 섭동 예측(Perturbation Prediction)에서 상수 기준선이 정교한 모델을 이기는 경우가 많다고 지적했다. 다만 일부 평가 지표가 잘 보정되어 있지 않다는 논문도 있으며, 더 적절히 보정된 지표에서는 딥러닝 모델이 평균 기준선을 넘어설 수 있다고 한다. 테이스는 기존 데이터셋에서의 섭동 예측은 복잡한 알고리즘을 정당화할 만큼 어려운 문제가 아니며, 분자에서 세포, 니치, 조직, 기관, 개체에 이르는 스케일 간 관계를 예측하는 문제가 더 중요하다고 본다.